这部电影由三个无关的故事组成。“她的记忆”：2092年，伊万诺夫领导的空间垃圾回收航天器在返回途中收到了来自“宇宙公墓”的求救信号。特别是，这个信号与歌剧《蝴蝶夫人》的咏叹调混合在一起。团队成员汉斯和米格尔去施

在“TokyoExplosion”的未知灾难背后，有一名暗中活跃的契约者——代号“黑”，被称为黑色死神的男人。制造了与“组织”敌对的事件，黑和他的同伴，身为DOLL的银一起踏上了逃亡之路。他们一边击退组织派来的刺客，一边向南方前进。在漫无尽头孤独的逃亡旅程中，两人可以信赖依靠的，只剩下彼此而已……

平凡的中学生鹿目圆（悠木碧 配音）有一个美满的家庭，在生活中她是个性格温顺又有爱心的好孩子。转学生晓美焰（斋藤千和 配音）的出现打破了小圆平静的生活，这个性格酷酷又体弱多病的黑长直少女似乎对小圆有着什么难言之隐。命运中的相遇出现了，小圆在路边救下了一只浑身是伤的奇怪动物 ，没想到这只动物居然会说人类

成为“第三次冲击”的罪魁祸首的Hideki变得像个瘸子……Shinji还能振作起来吗？在2012年《福音战士》新剧场版《Q》之后，这部动画讲述了《封印故事》的后续故事。

在被岛岛岛义子（岛岛岛义子的神秘人物）和岛岛岛义子（日本团体）绑架后，岛岛岛义子最初被岛岛岛义子（一群神秘人物）绑架。然而，出生在天空中的土达伦博士（贾公佳正配音）试图通过“地球温泉项目”彻底击败温泉G组。

在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子 配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹

由于阿里医生家的卫生间坏了，江户川（高山配音）和小兰（山崎和金井配音）以及阿原爱（林饰演）一起去公共浴室洗澡。在此期间，柯南意外滑倒并撞到了他的头，然后被两个神秘的陌生人带走。混乱之后，天才骗子娜娜（见李佳配音）和神秘杀手近藤（和川昭志配音）将失去记忆的柯南带到了一个隐蔽的别墅，伪装成他的父母，而追

突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“

美克（Miku）是个热爱新装甲摔角运动的女孩，为了参加女子争霸赛，挑战摔角坛最强的偶像巨星阿格玛琳，展开了地狱式的苦练。在教练的栽培和同伴的支持下，美克冲破了一个个难关。终于，她顺利来到了总决赛，在实力强劲的阿格玛琳反复的ryona下，美克终于领悟了摔角的真谛。